Pahandused temaga said alguse 1999. aastal, kui tema auto koduuksel koos sõbraga õhku lendas. Kaitsepolitsei hoidis teda toona kuu aega trellide taga. Kõlvartit kahtlustati sidemetes kuritegeliku maailmaga, kuid ta pääseb puhtalt süü tõendamatuse tõttu, sest kogu süü aeti toona tema õhku lennanud sõbra kaela.

Kaitsepolitsei huviorbiiti jäi ta edasi. Aastal 2012 ilmunud kaitsepolitsei aastaraamatus tutvustatakse 2011. aastal Yana Toomilt teatepulga üle võtnud ja Tallinna aselinnapeaks saanud Kõlvartit kui venekeelsete gümnaasiumide eestikeelsele õppele ülemineku vastu võitlejat, kes „jätkas eelkäija üleminekuvastast tegevust, lisades senisele avalikule tegevusele varjatud vastutegevuse“. Kapo aastaraamatus lisatakse: „Sellega seoses on tähelepanuväärsed M. Kõlvarti nii avalikud kui varjatud kontaktid Venemaa Suursaatkonna diplomaadi Juri Tsvetkoviga, mida viimane võib kasutada M. Kõlvarti mõjutamiseks ja suunamiseks.“